大棚种植石斛目前也成为主要的种植模式，只要肥水管理和病虫害防治措施得当，霍山石斛会生长得很好，瓶苗种植3年左右时，鲜品每亩产量可以达到300公斤左右，是传统仿野生种植模式的30倍以上。但同时，这种种植模式仍旧存在着不足：

1.设施投入较高。标准大棚建设成本在每亩6万元以上，如果加上苗床和配套设施设备（如浇水浇肥设备，降温设备等），每亩投入在10万元左右。如何降低成本投入，是一个值得思考的问题。

2.大棚顶部的遮阳网如果是不能活动的，会导致夏季之外的时间内，大棚内的光照不足，从而影响霍山石斛的生长。

3.中药材存在一个道地性问题，在大棚设施内，像霍山石斛的生长环境与野外环境相差太大，这种环境下种植出来的霍山石斛的品质是否与野生的相近，目前尚无定论，这不免会使消费者对利用这种种植模式种植出来的霍山石斛的品种存有疑问。这个问题还需要通过科学研究来回答。

4.由于在大棚设施条件下，一般种植密度较高，当种植密度过高时，霍山石斛容易发生病害（图8），因此对种植者来说，如何有效防治病害是一个难题。

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